Кроме ваших файлов есть еще логи и файлы статистики, их можно время от времени чистить, но мы не несем ответственности за возможные проблемы после удаления этих файлов.
Для серверов с панелью управления DirectAdmin файлы находятся в папках
/domains/yourdomain.com/stats
/domains/yourdomain.com/logs
